Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
AI481877A2ALV5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
AI481877A2ALV5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
AI481877A2ALV5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
AI481877A2ALV5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
AI481877A2ALV5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
AI481877A2ALV5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
AI481877A2ALV5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
AI481877A2ALV5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
AI481877A2ALV5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
AI481877A2ALV5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
AI481877A2ALV5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
AI481877A2ALV5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
AI481877A2ALV5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
AI481877A2ALV5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
AI481877A2ALV5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
AI481877A2ALV5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
AI481877A2ALV5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
AI481877A2ALV5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
AI481877A2ALV5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
AI481877A2ALV5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
AI481877A2ALV5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
AI481877A2ALV5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
AI481877A2ALV5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
AI481877A2ALV5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
AI481877A2ALV5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
AI481877A2ALV5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
AI481877A2ALV5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
AI481877A2ALV5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
AI481877A2ALV5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
AI481877A2ALV5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.81■■■■□ 3
AI481877A2ALV5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
AI481877A2ALV5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
AI481877A2ALV5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
AI481877A2ALV5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms