Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FocadA2AKG8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FocadA2AKG8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FocadA2AKG8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms