Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34dA2AGU5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms