Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhbdl2A2AGA4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhbdl2A2AGA4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhbdl2A2AGA4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms