Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chd5A2A8L1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd5A2A8L1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd5A2A8L1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Chd5A2A8L1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd5A2A8L1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd5A2A8L1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd5A2A8L1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd5A2A8L1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd5A2A8L1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd5A2A8L1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd5A2A8L1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd5A2A8L1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd5A2A8L1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd5A2A8L1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd5A2A8L1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd5A2A8L1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd5A2A8L1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms