Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fbxo47A2A6H3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo47A2A6H3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms