Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms