Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkd2l1A2A259 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l1A2A259 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l1A2A259 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms