Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trav12-2A0N8N6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trav12-2A0N8N6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trav12-2A0N8N6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trav12-2A0N8N6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trav12-2A0N8N6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trav12-2A0N8N6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms