Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Trbv21A0A0A6YX06 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Trbv21A0A0A6YX06 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Trbv21A0A0A6YX06 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv21A0A0A6YX06 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Trbv21A0A0A6YX06 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Trbv21A0A0A6YX06 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Trbv21A0A0A6YX06 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Trbv21A0A0A6YX06 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv21A0A0A6YX06 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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