Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms