Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms