Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr5Q9Z1P4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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