Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cldn9Q9Z0S7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cldn9Q9Z0S7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cldn9Q9Z0S7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cldn9Q9Z0S7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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