Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Snx1Q9WV80 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Snx1Q9WV80 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snx1Q9WV80 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snx1Q9WV80 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snx1Q9WV80 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snx1Q9WV80 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snx1Q9WV80 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx1Q9WV80 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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