Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nfe2l3Q9WTM4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nfe2l3Q9WTM4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Nfe2l3Q9WTM4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Nfe2l3Q9WTM4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfe2l3Q9WTM4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms