Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam50bQ9WTJ8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms