Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms