Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms