Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rdh11Q9QYF1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms