Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ChmQ9QXG2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms