Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms