Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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