Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Col5a3Q9JLI2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Col5a3Q9JLI2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Col5a3Q9JLI2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Col5a3Q9JLI2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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