Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
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Tlr5Q9JLF7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Tlr5Q9JLF7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Tlr5Q9JLF7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlr5Q9JLF7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Tlr5Q9JLF7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Tlr5Q9JLF7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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Tlr5Q9JLF7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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Tlr5Q9JLF7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Tlr5Q9JLF7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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Tlr5Q9JLF7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Tlr5Q9JLF7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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