Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms