Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nectin3Q9JLB9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nectin3Q9JLB9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nectin3Q9JLB9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms