Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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