Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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