Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup50Q9JIH2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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