Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc4Q9ES56 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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