Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms