Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms