Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms