Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Csnk1dQ9DC28 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Csnk1dQ9DC28 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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