Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms