Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBV4

Mxra8, Matrix remodeling-associated protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mxra8Q9DBV4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mxra8Q9DBV4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mxra8Q9DBV4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms