Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms