Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms