Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms