Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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