Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms