Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms