Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms