Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms