Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms