Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr42e1Q9D665 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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