Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3404Q9D506 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms