Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms