Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp35Q9D384 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms